缺血性脑卒中关键基因的筛选及治疗药物的预测

摘要

运用生物信息学方法初步筛选缺血性脑卒中(ischemic stroke,IS)相关的差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)和关键基因(hub genes),进而预测潜在的IS治疗药物。对正常组和双侧颈内动脉闭塞(bilateral internal carotid artery occlusion,BICAO)组的大鼠皮层进行转录组测序(RNA-sequencing,RNA-Seq),对筛选得到的DEGs进行GO和KEGG富集分析,并构建DEGs的蛋白互作网络,获得关键基因,根据关键基因预测IS相关药物。本研究共得到197个显著DEGs,这些基因主要参与代谢、神经活性配体-受体相互作用、补体和凝血级联反应、类固醇激素生物合成等途径。DEGs间有着紧密的相互关系,相互关系最为密切的基因中,ORM1、SERPINA1、GC都参加炎症、氧化应激和凋亡过程,是IS发病过程的关键基因。因此,炎症、氧化应激和凋亡在IS的发生发展中起重要作用,针对IS的关键基因如ORM1、SERPINA1、GC进行药物治疗有潜在的临床意义。