T细胞活化信号分子基因miRNA结合区域SNP与乙肝疫苗弱应答的关联研究

摘要

探讨与T细胞激活相关基因miRNA结合区域单核苷酸多态性(SNP)与乙肝疫苗弱应答的关联。采用病例对照设计,检测比较与T细胞激活相关基因miRNA结合区域SNP在乙肝疫苗正常应答组与弱应答组分布情况,及对乙肝疫苗抗体水平影响。经生物信息学预测,从T细胞激活相关的93个基因,发现30个相关基因miRNA结合区域有63个SNP,其中,有37个SNP位于11个基因的种子区,在中国人群最小等位基因频率(MAF)>10%的有20个。根据野生型等位基因和相应的突变型与miRNA结合自由能的改变情况≥2.80KJ/mol筛选出6个SNP作本研究备选SNP(rs1131579,rs17548629,rs12609318,rs344561,rs15927,rs3804033),rs12609318因为不符合HWE平衡而排除,比较77名弱应答者和207名正常应答者上述5个SNP基因型与等位基因型分布情况,差异无统计学意义(P>0.05),正常应答者的乙肝疫苗抗体滴度与单核苷酸多态性之间亦无关联(P>0.05)。本研究未能证明T细胞激活相关基因miRNA结合区域SNP与乙肝疫苗接种弱应答发生存在关联。