基于SLAF-seq技术的思茅松SNP位点开发

摘要

为开发大量的思茅松SNP标记,本研究以思茅松两亲本和100个杂交的Fl代遗传群体为研究对象,利用SLAF-seq测序技术进行测序。选择HaeⅢ酶进行酶切,长度在414~464 bp的酶切片段定义为SLAF标签,然后将每个样本和标签序列比对,以获得不同样本的SNP标记信息。结果表明,建库双端比对效率在84.91%,酶切效率为95.52%,SLAF建库正常。共获得507394471个数据,测序平均Q30为92.25%,GC含量为40.23%,分布正常。共获得633086个SLAF标签,其中多态性SLAF标签有239790个,共有140485个标签成功编码,共开发获得11544个SNP标记。本研究结果可以对思茅松优良基因实行精细定位,为优良性状筛选、种质资源的鉴定和群体进化等相关研究提供新的依据。