杜鹃花属序列中微卫星位点特征分析和引物开发

摘要

杜鹃是杜鹃花科(Ericaceae)杜鹃花属(Rhododendron spp.)的灌木植物。野生种质资源主要分部于我国四川、云南、贵州及长江流域各省,中国北方的大兴安岭、小兴安岭地区等也有分布。中国的杜鹃种类约占全世界种类的70%。杜鹃花是重要的花卉植物,也兼有保健食品、化妆品、药物开发及生物研究等价值。SSR标记是植物品种鉴定中最广泛使用的理想分子标记。在杜鹃花种质资源的系统分类、品种资源搜集、整理等方面,相关的研究还比较欠缺。杜鹃花属内种类繁多,至今在系统划分和某些种类的归属上仍然众说纷纭。我们鉴定了NCBI数据库公开杜鹃花属基因组序列的SSR序列位点;分析了杜鹃花属基因组序列中SSR位点的基序、重复数、碱基组成的特征;并设计了1 643对杜鹃花属SSR扩增引物。本研究是第一个杜鹃花属基因组序列SSR位点特征系统分析的尝试。本研究设计的SSR引物可满足所有常见杜鹃花品系的遗传关系分析,对促进杜鹃花野生种质资源保护、新品种培育,具有重要的意义。