条斑紫菜(Porphyra yezoensis)dbEST中筛选微卫星位点及引物种间转移扩增

摘要

采用电子查询的方法,借助Blast软件从条斑紫菜表达序列标签数据库的20979条序列中筛选微卫星位点,共发现非冗余微卫星位点211个,占整个条斑紫菜EST数据库的1.01%.其中双碱基重复微卫星位点共有35个,占查找微卫星序列总数的16.6%;三碱基微卫星有176个,占83.4%.双碱基重复微卫星中AG/CT形式最多,而三碱基中GGC/GCC最多.从筛选出的微卫星位点中选取序列设计合成引物,用在坛紫菜上进行引物种间转移扩增研究.在总共15对引物中有13对引物在两个种间都有扩增产物.结果表明,微卫星位点在这两种紫菜之间具有很高的同源性.获得的微卫星引物可用来进行种群遗传多样性研究、谱系鉴定和遗传图谱的构建.而微卫星标记的共显性可用来进行紫菜二倍体丝状体纯合性检验,为纯系紫菜品系的鉴定提供分子生物学鉴定方法.