萝卜(Raphanus sativus)Dof基因家族全基因组鉴定分析

摘要

Dof(DNA-binding with one finger)蛋白是一类在植物中起着关键作用的转录因子。本研究对萝卜Dof转录因子基因家族进行了系统进化关系、保守模体、染色体位置分布及不同组织表达模式分析。研究发现,萝卜基因组中鉴定出的63个Dof基因,分布于9条染色体上,可以分为9个亚族。十字花科(Brassicaceae)四种作物系统进化树的分析表明,该家族基因在植物中具有高度同源性。对其在不同组织和发育时期的表达模式研究发现,该基因家族具有一定的时空表达特异性。基因RsaDof03和RsaDof25在各个组织中表达量均相对较高,预测其参与萝卜不同的发育过程。本研究为进一步研究萝卜Dof基因家族的功能提供科学依据。