滇重楼根茎数字基因表达谱分析

摘要

本研究利用高通量测序技术对滇重楼根茎1年生龄段(R1)和3年生龄段(R3)进行基因表达谱分析。结果表明:R3相对于R1,上调的差异基因3 758个,下调的差异基因1 353个;GO数据库显著富集的差异基因涉及生物学过程、细胞成分及分子功能相关的共53种生理代谢功能;两组样品间差异表达基因涉及COG分类的25个生物学功能类别,其中翻译、核糖体结构和生物合成功能的Unigenes数目最多;KEGG注释表明R1、R3的差异表达基因Pathway涉及到5个功能大类、50个功能小类、2 016条代谢通路。以上研究结果对研究滇重楼根茎生长发育过程中的分子机制具有一定的参考价值。