蓖麻PDCT基因启动子的克隆及生物信息学分析

摘要

磷脂酰胆碱甘油二酯胆碱磷酸转移酶(phosphatidylcholine diglyceride choline phosphotransferase,PDCT)是种子中甘油三酯(triglyceride,TAG)积累过程中不饱和脂肪酸合成所必须的酶,因此在油脂合成和积累中起着重要的作用。本研究以‘通蓖5号’蓖麻品种幼嫩叶片为实验材料,根据美国国立生物技术信息中心(National Center for Biotechnology Information,NCBI)上已知蓖麻PDCT基因(LOC8282344)及其基因组(NW-002994322)序列设计引物,通过聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)扩增得到PDCT基因启动子片段。生物信息学分析PDCT蛋白的理化性质以及PDCT基因启动子序列。结果表明克隆到PDCT基因启动子序列3 741 bp,分析预测有多个转录起始位点及大量的顺式作用元件;PDCT基因共编码285个氨基酸,存在跨膜结构,为非分泌蛋白;对蛋白质编码的氨基酸进行同源性比对,并用MEGA 7.0构建了进化树,发现蓖麻和麻疯树,巴西橡胶树,木薯聚类到一起,这一分类与生物学分类一致,均为大戟科植物。对蓖麻PDCT基因及其启动子和蓖麻油脂合成代谢途径的进一步研究提供参考。