苹果新品种‘赤霞’和栽培品种遗传多样性分析和分子身份证构建

摘要

苹果新品种‘赤霞’是‘千秋’和‘津轻’的杂交后代中选育而来的中熟品种。本研究以‘赤霞’及其亲本和部分苹果栽培品种为试验材料,利用16对荧光SSR分子标记进行分子鉴定的同时构建了指纹图谱,通过GenAlEx 6.501软件分析了遗传多样性,并基于Jaccard系数利用Ntsys软件对SSR扩增结果进行了UPGMA聚类分析。在此基础上进一步选取7对稳定性高、重复性好、多态性强的荧光SSR引物,并运用条形码技术生成了‘赤霞’的分子身份证。采用的16对荧光SSR分子标记,共检测到95个等位基因位点,多态性等位基因数为3 (NH015a)~8 (CH02d08, CH05e03),平均每对引物检测到5.875个等位基因(Na),有效等位基因数(Ne)为2.192 (GD147)~5.478 (GD142)之间,平均值为3.436。观察杂合度(Ho)为0.550 (GD147)~0.952(CH01f07a)之间,平均值为0.772。期望杂合度(He)为0.544 (GD147)~0.817 (GD142),平均值为0.690。无偏杂合度期望值(uHe)为0.558 (GD147)~0.837 (GD142),平均值为0.707。香浓多样性指数(I)为0.960 (NH015a)~1.789 (GD142),平均值为1.386。固定指数(F)平均值为-0.119,说明供试苹果品种间含有的杂合子存在过量现象但是过量不明显,也说明供试材料接近于Hardy-Weinberg平衡。利用条形码技术生成的‘赤霞’与各供试材料的分子身份证互不相同,可以作为各栽培品种独有的可辨的特定谱带,为品种鉴定提供依据。苹果新品种‘赤霞’更多地遗传了父本的农艺性状,本研究从分子水平进行了验证。