基于RNA测序探索复发性流产生物标志物的研究

摘要

目的 分析复发性流产(recurrent spontaneous abortion,RSA)患者生物信息,探讨差异表达基因作为生物标志物的价值。方法 使用R语言分析RSA患者流产物测序数据,筛选差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),使用GSEA对DEGs注释,使用STRING分析DEGs编码蛋白间的相互关系(protein protein interaction,PPI),并筛选出候选基因。选取16例RSA患者(实验组)与16例人工流产患者(对照组)流产物绒毛组织,利用实时荧光定量PCR(real-time fluorescent quantitative PCR,qRT-PCR)验证候选基因。结果 共筛选255个DEGs,其中低表达基因219个,高表达36个。17个基因为可能的候选基因。经验证,实验组IL8、CCL20、CXCL9表达低于对照组,差异有统计学意义(P <0. 01),实验组AFP高于对照组,差异有统计学意义(P <0. 01)。结论 IL8、CCL20、CXCL9、AFP基因可能在RSA病理过程中起重要作用。