黄瓜转录因子TCP基因家族的鉴定及结构分析

摘要

TCP基因家族是植物中一类特有的转录因子家族,广泛参与植物的生长发育以及各种生理生化反应的信号传导。为了揭示黄瓜TCP基因家族的功能,本研究利用全基因组信息鉴定黄瓜TCP转录因子家族,分析结构特征及系统发育关系。结果表明,黄瓜全基因组共编码22个TCP转录因子成员,分布在5条染色体上;内含子/外显子结构分析表明,大多数TCP基因结构较为简单,不含有内含子;序列分析发现这些家族成员都含有高度保守的非典型bHLH结构域;根据结构域差异和系统发育关系分析的结果,将黄瓜TCP转录因子家族分成2个亚家族;启动子元件分析显示,TCP基因含有大量参与调控分生组织发育的元件。这些结果将为今后揭示黄瓜TCP基因家族成员的功能奠定理论基础。