河南主推旱稻品种SSR指纹图谱的构建及遗传差异分析

摘要

为构建河南早稻种植品种的DNA指纹图谱，了解河南早稻的遗传多样性，本研究利用均匀分布于水稻12条染色体的38对SSR引物，以河南主要推广种植的10个早稻品种为材料，进行遗传多样性分析并构建SSR指纹图谱。结果表明，35对引物具有多态性片段，共检测到108个等位基因，平均每位点3．1个等位基因；引物平均多态性频率为0．485。10个品种间的遗传相似系数为0．435～0．907，平均0．678。利用RM552、RM171、RM5、RM308、RM338、RM17和RM5877对多态性较高的SSR引物构建的核心指纹图谱能区分出10个旱稻品种。采用非加权类平均法进行聚类分析，在遗传相似系数0．480处可将10个品种分为籼、粳两大类。