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基于网络药理学与分子对接探究四逆汤治疗冠状动脉粥样硬化性心脏病的作用机制

         

摘要

目的:基于网络药理学和分子对接的方法,从分子角度对四逆汤治疗冠状动脉粥样硬化性心脏病(简称冠心病)的作用机制进行研究,探究四逆汤治疗冠心病的作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)检索四逆汤药物靶点,通过GeneCards数据库和OMIM数据库检索冠心病疾病靶点,通过VENNY 2.1软件得到交集靶点,再通过使用Cytoscape软件对交集靶点构建中药-成分-靶点调控网络,通过STRING数据库对交集靶点构建蛋白质-蛋白质相互作用网络,利用R×64进行基因本体论(GO)富集分析及京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,利用Autodock Vina软件进行分子对接。结果:获得四逆汤活性成分共118个,相对应的靶点1853个,核心成分为槲皮素、β-谷甾醇、甘草查尔酮a、柚皮素、水黄皮素等,核心靶点为肿瘤蛋白p53(Tumor Protein p53,TP53)、JUN原癌基因(Jun Proto-Oncogene,JUN)、信号转导因子和转录激活因子3(Signal Transducer and Activator of Transcription 3,STAT3)、丝裂原活化蛋白激酶(Mitogen-Activated Protein Kinase,MAPK)3、MYC原癌基因蛋白(Myc Proto-oncogene Protein,MYC)、缺氧诱导因子(Hypoxia Inducible Factor,HIF)1A、雌激素受体(Estrogen Receptor,ESR)1、MAPK1等。获得冠心病相关靶点共7737个,与四逆汤药物靶点的交集靶点共184个。通过Cytoscape软件构建中药-成分-靶点调控网络,最终得到节点284个、作用关系1489条。GO富集分析得到2763个条目,包含2433个生物过程条目、100个细胞组成条目和230个分子功能条目。KEGG分析得到178条通路。分子对接结果显示核心成分与核心蛋白具有较好的结合能。结论:四逆汤治疗冠心病具有多成分、多靶点、多通路的机制特点,可有效防治冠心病,为实验或临床研究提供基础。

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