淋球菌por,tbpB基因序列变异和系统进化探讨

摘要

目的分析遵义地区淋球菌por,tbp B基因序列变异及系统进化关系。方法对淋球菌por,tbp B基因进行测序鉴定,利用NG-MAST分型法对por,tbp B基因进行比对编号。用MEGA5.22软件中的邻接法构建系统发育树,并以Kimura 2-parameter模型计算序列间的遗传距离;Felsenstein法计算同义替换率(dS)和非同义替换率(dN)。以RDP3软件对por,tbp B基因中的基因重组事件进行分析。结果 65株淋球菌共鉴定出19种por基因型和22种tbp B基因型。19种por基因型被划分为2个进化簇群,基因间平均遗传距离0.09。22种tbp B基因型被划分为3个进化簇群,基因间平均遗传距离0.13。por,tbp B基因的dN