基于16S rDNA部分序列探讨中国近海30种石斑鱼类的分子系统进化关系

摘要

石斑鱼因其种类繁多、分布广泛及缺乏显著的形体特征,使其系统分类的研究颇为困难.为探讨中国近海石斑鱼类的系统进化关系,通过PCR扩增获得了石斑鱼亚科(Epinephelinae)6属30个种类的线粒体16S rDNA基因片段序列.采用多个生物软件对序列变异和碱基组成进行分析,计算了Kimura 2-parameter遗传距离、转换/颠换比等遗传信息指数,并结合GenBank石斑鱼属的同源序列,以多纹长尾NFDA7(Pronotogrammus multifasciatus)和皮氏叫姑鱼(Johnius belengerii)为外群构建NJ、MP和ML系统树.根据所得分子依据并结合形态学特征,推论如下:1)在本研究的30种石斑鱼中,鳃棘鲈属(Plectropomus)最先分化,并呈明显单系性;九棘鲈属(Cephalopholis)是一个单系群,并且较石斑鱼属(Epinephelus)原始;侧牙鲈属(Variola)的进化地位介于鳃棘鲈属与九棘鲈属之间; 2)宽额鲈(Promicrops lanceolatus)可以归入石斑鱼属, 而驼背鲈(Cromileptes altivelis)也与石斑鱼属有很近的亲缘关系,甚至可能是石斑鱼属内的特化类群; 3)石斑鱼属内部存在两个平行进化的姐妹分支,分支内部的种类组成与地理分布无关,暗示了石斑鱼属早期的分化模式[动物学报 52(3):504-513,2006].