延安地区马铃薯纺锤块茎类病毒的RT -PCR 检测与序列分析

摘要

以陕西省延安地区8个乡镇种植2～3代的马铃薯叶片为材料，Trizol法提取马铃薯叶片总RNA，以已公布的马铃薯纺锤块茎类病毒（PSTVd）基因序列设计合成特异引物，反转录合成cDNA，RT-PCR扩增目的基因片段并电泳检测，回收纯化目的片段，然后进行克隆和测序，采用DNAstar软件分析序列一致性。结果显示：在马铃薯叶片中均扩增到与预期大小一致的目的片段，表明这些乡镇的马铃薯均感染了PSTVd，8个采样点PSTVd的目的片段大小为247～251 bp，出现少量碱基的突变或缺失，说明PSTVd在延安地区部分乡镇发生了一定程度的变异，与国内外其他14个地区之间的序列一致性为80.4％～99.2％。