聚类分析中类数估计方法的实验比较

摘要

在基因表达数据的探索性聚类分析中,聚类个数的确定是决定聚类质量的关键因素.许多聚类有效性评价指标和方法可用于PAM聚类算法.该文讨论适合于PAM算法的7种常用评价指标和方法,采用4种不同聚类结构特征的基因表达数据对它们的性能进行实验比较.结果表明,系统演化方法和稳定性方法估计聚类个数的性能最好,正确率分别为100%与90%.