重亚硫酸盐修饰直接测序技术检测p16基因甲基化的研究

摘要

目的建立稳定的重亚硫酸盐直接测序技术,检测p16基因甲基化状况.方法提取正常人全血基因组DNA,建立起稳定的重亚硫酸盐直接测序平台,利用该技术检测结直肠癌细胞株p16基因甲基化状况.结果应用列联表的Fisher,Exact Test比较3种纯化方法的测序结果,乙醇/醋酸钠和过柱纯化与SAP-ExonI纯化法比较,测序结果差异有统计学意义(P＜0.05);应用重亚硫酸盐直接测序技术,可检测出p16基因目的片段中CpG岛所有CpG位点的甲基化状况.结论应用SAP-ExonI纯化法,建立了稳定的重亚硫酸盐直接测序技术,并可检测出目的片段中CpG岛所有CpG位点的甲基化状况.