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猪链球菌2型强弱毒株对BALB/c小鼠肠道菌群影响的差异

     

摘要

目的 旨在探究猪链球菌2型强弱毒株对BALB/c小鼠肠道菌群的影响差异.方法 本研究随机将3周龄的雌性BALB/c小鼠分为3组,即空白对照组、猪链球菌2型强毒株SS2-1感染组和弱毒株HA0609感染组.采用Illumina Miseq测序技术,测定了小鼠结肠粪便样品中微生物16S rRNA V3-4区序列,并对其微生物群落结构和多样性进行了比较分析.结果 各组样本测序覆盖率均达到99%以上,实验数据可靠.三组小鼠在菌群丰度和构成上均存在差异,SS2-1感染组小鼠的肠道菌群OTU数量与Alpha多样性均高于HA0609感染组和Mock组,HA0609感染组与Mock组相似度较为接近.相对于HA0609感染组和Mock组,SS2-1感染组菌群结构改变,益生菌所占比例减少,致病菌或潜在致病菌增多,存在肠道菌群失调现象.根据LEfSe分析结果,预测变形杆菌门下的Alphaproteobacteria可作为猪链球菌2型感染的潜在鉴别生物标志.结论 通过本研究,不仅对猪链球菌2型强弱毒株感染后小鼠的肠道菌群的丰度、多样性和构成有了一定的认识,而且筛选到了猪链球菌2型感染BALB/c小鼠后的潜在标志物Alphaproteobacteria,为通过调整肠道微生物治疗猪链球菌2型和预防猪链球菌2型感染提供了依据.

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