我国鸡源与人源H9N2亚型流感病毒聚合酶PB1基因的关系分析

摘要

目的通过对1996～2001年自我国部分养鸡场分离鉴定的8株H9N2亚型鸡流感病毒聚合酶PB1基因测序,了解鸡源与人源H9N2 亚型流感病毒聚合酶PB1基因的关系.方法病毒在鸡胚中传代,自收获的尿囊液提取RNA,通过RT-PCR,扩增聚合酶PB1基因片段,并进行序列测定,测序结果采用PHYLIP软件在Internet 网上分析处理,并用TreeView软件绘制系统进化树.结果 8株H9N2亚型鸡流感病毒聚合酶PB1基因的核苷酸同源性为97.4%～99.7%,与三株人源H9N2 病毒A/Guangzhou/333/99、A/Hong Kong/1073/99、A/Hong Kong/1074/99的同源性分别为90.6%～91.9%、90.4%～91.5%、90.2%～91.3%.该8株鸡源H9N2病毒PB1基因属于相同的进化分支,即A/duck/Hong Kong/Y280/97-like分支,而与该3株人源株H9N2 病毒属于不同的进化分支;尚未发现PB1基因属于A/quail/Hong Kong/G1/97或A/duck/Hong/Y439/97分支的鸡源分离株.结论在我国养鸡业流行的H9N2病毒分离株与目前已分离的人源株H9N2病毒其PB1基因属于不同的进化亚分支,人源株H9N2病毒PB1基因不是来源于鸡源H9N2病毒.