3种炭疽菌P型ATP酶基因家族分析

摘要

P型ATP酶是一类可以被ATP驱动其发生磷酸化的阳离子泵.利用TCDB (Transporter Classification Database)网站数据库中的P型ATP酶氨基酸序列对3种炭疽菌(禾谷炭疽、希金斯炭疽、胶孢炭疽)全基因组数据库进行搜索,结合结构域分析和进化树聚类分析,共找出候选P型ATP酶基因禾谷炭疽菌26个,希金斯炭疽菌37个,胶孢炭疽菌29个.对这些候选基因进行基因功能预测发现其主要参与转运Na+/K+、Ca2+、重金属离子以及磷脂的功能.利用MEME程序分析,从3种炭疽菌中均鉴定获得20个基序,其中有6个基序相同.这为深入研究炭疽菌P型ATP酶家族基因生物学功能奠定了基础.