不同产地太子参芜菁花叶病毒CP基因的分离与序列差异性分析

摘要

通过对不同产地的8份太子参病叶样品进行芜菁花叶病毒(Turnip mosaic virus,TuMV)外壳蛋白(coat protein,CP)基因的RT-PCR检测,从其中7份样品中扩增得到特异性目的条带,对所获得的13个克隆子序列进行下一步的序列分析.结果显示:所得CP基因序列均为775 bp,存在36个核苷酸多态性位点,总变异数为37个,部分点突变仅在某产地发现,可能存在重组;各地分离物之间的遗传分化程度高,遗传漂变可能是造成遗传分化的主要原因;在系统进化树分析结果中,太子参TuMV CP序列均聚类在World B组,并呈现一定的地域特异性.本研究为建立更有效的太子参TuMV检测方法和针对性制定病毒病防控策略奠定重要基础.