海南普通野生稻自然居群间遗传多样性的微卫星分析

摘要

采用48个SSR标记分析了海南11个普通野生稻自然居群的遗传多样性.结果显示海南普通野生稻自然居群具有较丰富的遗传变异(Na=8.3,He=0.716).居群内多数等位基因(77.6%)频率较低,其中,70个等位基因仅出现在1个居群中.62.9%的等位基因显著偏离哈迪-温伯格平衡,多数居群及等位基因实际杂合度大于期望杂合度,表明居群内自交率低、杂合体过剩.居群间遗传变异差异明显,在11个自然居群中,崖城居群遗传多样性最低(Na=1.7,He=0.348),和庆、椰林B两居群遗传变异最为丰富(和庆:Na=4.0,He=0.577;椰林B:Na=4.0,He=0.531).Mantel测验表明,居群间Nei遗传距离与地理距离呈极显著相关(r=0.386,P=0.004).东、西海岸居群间遗传分化显著但较小(Fst=0.048,P=0.024),而居群间遗传分化则较大(Fst=0.335,P＜0.001).11个自然居群间基因流非常有限(Nm=0.404),表明居群间隔离程度较大.基于居群等位基因数目、基因多样性指数以及基因频率特点,认为海南11个自然居群中和庆和椰林B居群应是优先保护对象.