中国规模化猪场猪肠道菌群和抗生素耐药基因组特征

摘要

肠道微生物与宿主的能量代谢、免疫系统的发育及其它生理功能密切相关。关于人类肠道微生物与宿主的互作机制已经有了广泛研究。同样,动物的肠道菌丛也参与调解很多生理机能。与人类相比,虽然已经有研究利用16S rRNA以及宏基因组测序来开展猪的肠道菌丛研究,但所知有限。尤其是规模化养殖场猪肠道微生物组数据的缺乏严重制约了相应基因结构及功能的研究。2016年,在收集法国(100份)、丹麦(100份)以及中国(87份)猪粪便样品的基础上,利用宏基因组测序建立了猪肠道菌丛的参考目录,这是一个很有吸引力的重要模型。