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猪蛔虫全基因组微卫星分子标记开发与特征分析

     

摘要

为了从全基因组水平筛选猪蛔虫微卫星分子标记,通过PCR扩增和毛细管电泳技术进行基因分型.结果显示,筛选获得了25个能稳定扩增并具有多态性的微卫星位点.这些位点的等位基因数(NA)为2~25个,观测杂合度(H0)和期望杂合度(HE)分别为0~1和0.042~0.945,多态信息含量(PIC)为0.040~0.921,其中20对显示中、高度多态性,无效等位基因频率(F)和近交系数(FIS)变化区间为0~0.197 1和-0.198 5~1,显示杂合子缺失.25对微卫星分子标记中有15对符合哈迪-温伯格平衡,10对或多或少的偏离平衡.且这些位点均能在人蛔虫中稳定扩增.本试验开发的微卫星标记可为蛔虫的种群遗传学、流行病学、宿主特异性、遗传结构、交配模式等研究提供有效的工具.

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