2012年～2014年我国东南地区HP-PRRSV GP5基因的遗传进化与变异分析

摘要

为分析高致病性猪繁殖与呼吸综合征病毒(HP-PRRSV)的遗传变异情况,本研究对2012年～2014年东南地区8个省市21份HP-PRRSV阳性样品的GP5基因进行了RT-PCR扩增、克隆和测序,并将其进行序列比对和遗传进化分析.结果表明:本研究检测的21株HP-PRRSV GP5基因的核苷酸和氨基酸同源性分别为81.1％～99.8％和75.1％～100％.其中有13个病毒株的GP5基因与JXA1株同属于2.2亚群,其余8个病毒株的GP5基因与台湾2007年、2013年分离株属于2.3亚群.遗传进化树分析表明,2.3亚群是2014年流行的一个新兴亚群,它的流行可能与两地猪群贸易交流频繁有关,其GP5基因在抗原表位和糖基化位点发生了一定的变异.本研究结果为HP-PRRSV遗传进化分析和疫病防制提供了新的参考.