一株H3N2亚型犬流感病毒的分离鉴定及遗传进化分析

摘要

为了解犬流感病毒(CIV)在广州地区的流行和进化情况,本研究从广州市宠物医院采集了230份犬鼻咽拭子样品,接种10日龄SPF鸡胚,进行CIV的分离和鉴定,并对其全基因组序列进行分析.结果表明,从这些样品中仅分离鉴定出一株H3N2亚型CIV A/canine/Guangdong/01/2014 (H3N2).对该病毒株全基因组的遗传进化分析表明,分离株的PB2、PB1、PA、NP、HA、NA、M、NS 8个基因均为CIV,未发生重组;HA和NA基因与我国广东地区分离的H3N2亚型CIV属于同一个分支,氨基酸同源性分别达98.2％和97.0％.本研究结果为明确华南地区CIV的流行进化情况提供了基础数据.