目标区域捕获测序检测到一视网膜色素变性家系ABCA4基因新突变

摘要

目的研究我国一个常染色体隐性遗传的视网膜色素变性（RP）家系患者的临床表型及致病基因突变，并分析表型与基因型间的关系。方法实验研究。收集了宁夏人民医院眼科诊治的一个RP家系的临床资料，共有7名家庭成员参与研究，其中包括2名患者和5名正常成员。完善家系内所有参与成员的眼科检查，包括最佳矫正视力（BCVA）、视野、眼底照相、光学相干断层扫描（OCT）及全视野视网膜电流图（ERG）等。针对180个已知的遗传性视网膜疾病致病基因及9个高度可疑的候选基因设计目标区域捕获芯片，利用该捕获芯片对先证者（Ⅳ-4）进行目标区域内的高通量二代测序，借助优化的生物信息学分析对捕获的遗传变异进行筛查过滤，最终通过家系内共分离验证确认致病突变，进一步分析该突变与患者表型间的关系。结果临床检查结果表明该家系内的2名患者的临床表现均符合典型的RP改变，遗传学分析结果证实了ABCA4基因c．419G〉A突变是该家系的致病突变。该突变导致了ABCA4基因所编码的蛋白第140号氨基酸由精氨酸变为谷氨酰胺（p．Arg140Gln），保守性分析显示该突变位点在各物种中高度保守，PloyPhen-2软件预测结果表明该突变具有较高的致病性。结论本研究借助基于高通量二代测序平台的目标区域捕获测序，首次发现了ABCA4基因新突变p．Argl40Gln是一个常染色体隐性遗传RP家系的致病突变，进一步扩充了ABCA4基因的遗传突变谱及表型谱。