采用基因芯片技术获取人脑胶质瘤差异表达的基因及一条全长新基因的研究

摘要

目的运用基因芯片技术获取正常成人脑组织与人脑胶质瘤中差异表达的基因,并对其中一条基因进行了初步的研究.方法抽提正常成人脑组织与人脑胶质瘤组织中的mRNA来制备探针,经杂交、洗涤后,通过计算机观察二者表达谱的差异情况,对436F11克隆子进行了northern blot,原位杂交和生物信息学分析.结果通过四次基因芯片筛选,获得15条与胶质瘤相关的新基因,经northern blot证实436F11基因在人正常脑组织中高表达,而在人脑胶质瘤中低表达.原位杂交得到相同的结果.BLASTn和BLASTx分析显示,436F11基因为全长新基因,共编码78个氨基酸,其理论分子量为8648Da,等电点为4.69,与鼠PKIβ69%同源,命名为人PKIβ.结论基因芯片筛选正常脑组织与人脑胶质瘤差异表达的基因具有样品用量少、高质量、高速度、高敏感等特性.人PKIβ可能是与人脑胶质瘤形成有关的一条全长新基因,这为脑胶质瘤的基因治疗提供了一条新思路.