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神经胶质瘤干细胞向内皮细胞分化的差异基因表达谱的分析

         

摘要

目的检测并分析胶质瘤干细胞(GSCs)低氧诱导分化为内皮细胞过程的差异基因表达谱的关键通路和基因, 为恶性胶质瘤的治疗寻找新的靶基因。方法从U87胶质瘤细胞株中提取GSCs细胞并进行免疫荧光鉴定;将GSCs在水凝胶上低氧诱导分化, 并对分化后的内皮细胞进行免疫荧光鉴定;收集并提取细胞总RNA, 用基因芯片检测分化前、后的细胞差异表达基因, 进而分析差异基因的显著靶向性功能和差异基因参与的信号转导通路, 从而筛选出关键调控信号通路和基因。结果提取的GSCs表达CD133、Nestin、SOX2等干细胞标志物;低氧诱导5 d后细胞表达CD31、CD34两种内皮细胞标志物;差异基因表达谱存在481个上调基因及245个下调基因(差异倍数&2), 筛选出转化生长因子β(TGF-β)信号通路、脂肪酸合酶(FASN)、脯氨酰-4-羟化酶亚基α1(P4HA1)等多个有意义的通路和基因(均P&0.01)。结论 U87细胞中提取的GSCs可经体外低氧诱导分化为内皮细胞, TGF-β信号通路、FASN及P4HA1可能成为胶质母细胞瘤具有前景的治疗靶点。

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