微小RNA在丁酸钠诱导胚胎干细胞分化为肝细胞过程中表达差异谱的变化

摘要

目的 探讨微小RNA(microRNA)在丁酸钠诱导胚胎干细胞分化为肝细胞过程中表达差异谱的变化,为进一步研究microRNA调控胚胎干细胞向肝细胞分化的分子机制奠定基础.方法 分别于丁酸钠诱导小鼠胚胎干细胞向肝细胞分化过程中的第0、6、9天提取细胞总RNA,并分离获得分化细胞microRNA.利用micr0RNA芯片技术将细胞microRNA与哺乳动物microRNA芯片杂交,采用LuxScan 3.0图像分析软件和SAM(version 2.1)软件对芯片杂交结果进行数据分析,筛选出明显差异表达microRNA并进行靶基因预测.结果 胚胎干细胞向肝细胞方向分化6 d时明显差异表达的microRNA共39个,其中17个表达上调、22个表达下调;9 d时明显差异表达的micmRNA共44个,其中17个表达上调,27个表达下调.明显时相差异表达的36种microRNA中15种与组蛋白去乙酰化酶相关联.结论 在丁酸钠诱导胚胎干细胞向肝细胞分化过程中,组蛋白去乙酰化酶及与其相关的microRNA很可能具有重要的调控胚胎干细胞生长和分化的作用.