一起疑似无菌性脑膜炎暴发疫情样本中肠道病毒的分子检测与序列分析

摘要

目的 对一起发生于浙江金华市某幼儿园的疑似无菌性脑膜炎疫情样品进行肠道病毒的分子检测及序列分析。方法 抽提病毒RNA并逆转录,利用肠道病毒通用引物分别扩增病毒基因组的5′-非翻译区（untranslated region,UTR）及VP1基因部分片段。通过比较VP1基因片段的同源性对病毒进行分型,并利用MEGA6软件对病毒VP1基因片段进行系统发育树分析。结果 7名发病患者及26名无症状学生中,48.5%为柯萨奇病毒A10型（coxsakievirus A10,CV-A10）感染,21.2%为埃可病毒6型（echovirus 6,Echo 6）感染,12.1%可能存有两种病毒共感染的情况。7名发病患者中,6名患者的检测结果为CV-A10感染,而另外1名可能为两种病毒共感染。系统发育树分析中本研究的CV-A10病毒株与近年来中国大陆地区CV-A10流行株亲缘关系较近,如2015年厦门株、2017年云南株等。而Echo 6病毒株与2014年中国云南、广州、山东的Echo 6流行株亲缘关系较近。结论 本次疑似无菌性脑膜炎暴发疫情样品中主要检测到CV-A10及Echo 6两种肠道病毒血清型,且两种血清型的病毒株与近年来中国大陆地区相应血清型的流行株亲缘关系较近。