人巨细胞病毒UL148A、UL148B、UL148C、UL148D基因在临床株中的多态性研究

摘要

目的 研究人巨细胞病毒(human cytomegalovirus,HCMV)UL148A、UL148B、UL148C和UL148D基因序列在临床低传代分离株中的多态性.方法 对22株经荧光定量PCR方法(Q-PCR)检测HCMV-DNA为阳性的临床株进行HCMV UL148A、UL148B、UL148C和UL148D基因全序列PCR扩增,并对PCR扩增产物进行序列测定及分析.结果 22株临床株序列与Merlin株相比,临床分离株UL148A基因的核苷酸变异率为0.5%～8.3%,氨基酸变异率为1.3%～6.3%;UL148B基因核苷酸变异率为0.5%～4.6%,氨基酸变异率为1.3%～5.0%;UL148C基因核苷酸变异率为0.5%～3.0%,氨基酸变异率为1.3%～3.9%;UL148D基因核苷酸变异率为0.6%～8.5%,氨基酸变异率为1.7%～8.1%.22株HCMV UL148A和UL148D序列均分为3个型.与Merlin株比较,除U96株外,来自未经传代的尿标本中的UL148A、UL148B、UL148C和UL148D基因编码产物含有的翻译后修饰位点均保守.结论 UL148C基因无论在核苷酸序列还是在蛋白的氨基酸结构上均较为保守.统计学分析显示HCMV UL148A和UL148D基因呈现一定的相关性.