幽门螺杆菌ureB基因的克隆及序列分析

摘要

目的 对幽门螺杆菌 （Hp）ureB核苷酸序列及推定氨基酸序列进行同源性比较分析 ,确定Hp菌株的ureB基因差异性 ,为疫苗的研究和诊断用品的评价提供依据。方法 自行设计引物 ,PCR扩增来自国内不同病人的 4株Hp菌株的ureB基因 ,与pGEM T载体克隆连接、测序 ;进一步同GenBank上发表的其他 4株国外Hp菌株ureB的全基因序列进行比较分析。结果 8株Hp菌株的ureB基因序列出现了 3种长度 ,CAPMF3和CPM6 30分别为 12 6 9bp和 16 80bp ,其他为 1710bp。 6株1710bp的ureB基因序列的分析表明 ,国外 3株Hp的ureB同源性较高 ,三者氨基酸的同源性达到10 0 %。而国内 3株Hp的ureB变异较大 ,推定氨基酸同源性为 98 7%～ 98 9%。结论 UreB作为保护性抗原时存在免疫保护覆盖率问题 ,研究疫苗和诊断用品时要注意选择使用在人群中流行占优势的Hp菌株的高度保守的UreB抗原肽 ,使其具有更高的覆盖率。