儿童来源肠道沙门菌肠道亚种非A～F群血清型分离株的耐药性及分子流行病学和毒力基因分布

摘要

目的 分析肠道沙门菌肠道亚种非A～F群血清型分离株的耐药性、分子流行病学和毒力基因分布情况,以明确其流行特点,为临床诊疗提供流行病学依据.方法 针对浙江大学医学院附属儿童医院2017-2020年收集的11株肠道沙门菌肠道亚种非A～F群血清型分离株,进行血清分型及抗菌药物敏感性试验,并进行全基因组测序,进而对测序结果进行血清型、多位点序列分型和毒力基因分析.结果 本院肠道沙门菌肠道亚种非A～F群血清型分离株检出率较低,占比1.13％.11株菌株中,包含长湾尼血清型3株,非丁伏斯血清型2株,汪兹沃思、波摩那、凯杜古、厄班那、浦那、库马西血清型各1株.11株非A～F群肠道沙门菌肠道亚种分离株中除2株多重耐药株外,其余菌株对绝大多数抗菌药物均敏感,且最低抑菌浓度(MIC)均处于较低水平.11株菌共检测出9种ST型,3株长湾尼血清型菌株均为ST3918,其他分离株分别为不同的ST型.通过核心基因组构建进化树显示3株长湾尼血清型菌株亲缘关系紧密.11株菌株共检测出毒力基因103种,包含分泌系统相关基因78种,黏附相关基因21种,镁吸收相关基因2种,抗菌肽耐药性相关基因1种,伤寒毒素相关基因1种.结论 本院肠道沙门菌肠道亚种非A～F群血清型分离株的检出率较低,对常见抗菌药物敏感性较高,ST型及亲缘关系呈多样性分布.临床实验室应关注肠道沙门菌肠道亚种非A～F群血清型分离株的检出,并持续关注其耐药性和毒力基因变化.