ShineRoar探针技术检测单核苷酸多态性

摘要

目的 建立一种低成本、高效率、操作简便的单核苷酸多态性(SNP)检测技术.方法 采用自行设计的"ShineRoar探针",结合融解曲线技术检测目的 基因SNP.并根据其工作原理分别对肿瘤坏死因子受体Ⅱ(TNFRⅡ)和载脂蛋白M(apoM)的基因多态性进行检测;同时用DNA测序技术鉴定ShineRoar探针技术的准确性.结果 融解曲线分析结果显示,某一基因的野生型及突变型纯合子分别在2个不同的融解温度出现融解谷.TNFRⅡ基因第6外显子196位突变(ATG→AGG)所产生的T和G等位基因的融解温度分别为(52.84±0.75)℃和(58.38±0.61)℃;apoM T-778C突变所产生的T和C等位基因的融解温度分别为(42.55±0.73)℃和(49.19±0.57)℃.一致性Kappa检验显示ShineRoar探针技术与DNA测序技术的SNP检测结果一致(Kappa=1,P=0.000).结论 ShineRoar探针技术简单、快速、准确,适用于大批量基因分型的研究.