新型分泌蛋白C6ORF120结构及功能的生物信息学分析

摘要

目的:采用生物信息学方法预测C6ORF120蛋白的结构和生物学功能。方法:获取Genecards、Uniprot数据库中C6ORF120蛋白的FASTA序列,运用生物信息学工具分析C6ORF120蛋白的理化性质、亲水性/疏水性、二级结构、结构域、信号肽、跨膜区及其可能的生物学功能。结果:C6ORF120蛋白编码基因位于染色体6q27,主要存在于肝脏血液/免疫细胞的T细胞。C6ORF120蛋白是一个长度为191个氨基酸序列的分泌蛋白,属于亲水、不稳定的酸性蛋白质,大小为20.77 kD,在不同物种间呈高度保守。C6ORF120蛋白的信号肽位于1~31位氨基酸,不存在跨膜区,结构域位于7~191位氨基酸序列,属于UPF0669/pFam17065家族。C6ORF120蛋白的翻译后修饰有O-糖基化位点4个、N-糖基化位点1个、磷酸化位点16个,并且该蛋白与SDCBP、RNASET2等多种蛋白作用紧密,具有水解酶活性,可能参与多条糖脂分解代谢过程。结论:C6ORF120蛋白是亲水不稳定的分泌蛋白,可能在体内参与肝脏多种T细胞介导的生物学过程及肝脏相关疾病的免疫调节。