基因微阵列分析大鼠肝脏热缺血损伤功能基因的差异表达

摘要

目的分析热缺血损伤后大鼠肝脏基因表达谱的改变,初步确定热缺血损伤发病分子机制过程中调控基因。方法采用基因表达谱芯片RAE230分析SD大鼠原位热缺血模型处理前后基因mRNA转录本含量的改变;确定目标基因并联机检索GeneBank等整合数据库,按其生物功能分类进行批量筛选;并应用Gene Cluster3.0生物信息可视化分析软件进行等级聚类分析。用荧光定量逆转录聚合酶链反应法验证目标基因GAPDH、Hsp70、CyclinD1的表达变化,验证芯片分析的初步结果。结果分别得到了正常对照组、缺血组的肝脏基因表达数据和变化显著基因直观图示。对比分析发现,在总共8804个表达的基因（表达率为55.3%）中,实验组有927个基因表达下调,885个基因表达上调,其中变化幅度大于3倍的分别有40个和29个（P＜0.01）;按其生物学功能分类属能量代谢、组织修复、信号转导类分子的调控。结论30 min热缺血损伤处理后,SD大鼠基因的表达谱发生改变,实验分析证实热缺血损伤的分子调控机制涉及多个基因表达调控途径。研究这些基因分子功能有助于为外科临床防治热缺血损伤提供实验依据。