基于隐马尔可夫模型对原核生物编码序列的识别

摘要

目的 探讨隐马尔可夫模型在大肠杆菌编码序列识别中的应用,为生物信息挖掘、致病位点研究提供方法参考.方法 对大肠杆菌训练集数据进行训练建模,并对测试序列进行识别,用特异度、灵敏度以及精确度三个指标进行评价.结果 利用本试验的方法识别编码序列的灵敏度为73.33％,特异度为67.78％,精确度为70.56％.结论 隐马尔可夫模型能很好地模拟离散状态间的转换,适用于识别有状态转移、线性序列的数据.