基于分子对接和网络药理学的黄芪-桑寄生-木瓜药对治疗骨关节炎的作用机制

摘要

目的 通过分子对接与网络药理学途径探究黄芪-桑寄生-木瓜药对治疗骨关节炎(OA)分子的机制.方法 通过从TCMSP数据库搜索黄芪-桑寄生-木瓜药对中每味中药化合物成分,并预测其潜在靶点.利用GeneCards数据库和OMIM数据库收集OA的作用靶点,将两者预测的潜在作用靶点进行映射,获得共同作用靶点.运用STRING数据库进行靶点蛋白相互作用关系,使用Cytoscape3.7.0软件对其网络进行构建及分析.使用DAVID数据库对共同作用靶标进行富集分析.通过Auto Dock软件对其重要化合物与疾病相关重要靶点进行分子对接.结果 黄芪-桑寄生-木瓜药对含有19个重要化合物对应靶点基因98个,OA作用靶点549个,共同作用靶点26个.通过STRING分析发现,白细胞介素(IL)-6、胱天蛋白酶(CASP)3、血管内皮生长因子(VEGF)A等靶点作用最为密切;Kegg代谢通路富集分析表明,共同作用靶点富集的通路中有10条代谢通路与KOA关系最为密切,主要涉及TNF信号通路、p53信号通路、NF-κB信号通路、NOD样受体(NLR)信号通路和Toll样受体(TLR)信号通路等炎症信号通路.分子对接结果提示槲皮素、山奈酚等重要化合物与CASP3、IL-6等疾病相关重要靶点结合紧密,亲和力较好.结论 运用分子对接及网络药理学的方法研究了黄芪-桑寄生-木瓜药对用于OA(尤其是老年OA)的潜在作用机制,以期为临床应用及进一步的实验研究提供依据.