不同乙醇预处理方式对LMD分离牙胚组织总RNA完整度的影响

摘要

目的:探求不同乙醇预处理方式是否对激光显微切割(Laser microdissection,LMD)技术分离获得的小鼠牙胚组织总RNA完整度有影响.以提高LMD技术获取样品的完整度,使之满足后续基因芯片等高通量实验对样品的质检要求.方法:本实验按照LMD切割前是否乙醇预处理的方式分为无预处理LMD组、梯度乙醇处理组以及100％乙醇处理组三组.以LMD技术获取胚胎17天(Embryonic 17,E17)和出生后2天(Postnatal 2,PN2)两时期CD1小鼠下颌第一磨牙的牙胚组织；提取各组总RNA,再以核糖体RNA 28s/18s比值、RNA完整度数值(RNA Integrity Number,RIN),以及样品电泳图的图形来综合判断样品完整度.数据进行统计分析.结果:100％乙醇处理组,RIN值最高且与另两组相比差异有显著性,梯度乙醇处理组RIN值与无预处理LMD组相比,并无显著性差异；以28s/18s比值为指标,100％乙醇预处理组高于其它两组,但差异并无显著性;梯度乙醇处理组与无预处理LMD组间差异亦无统计学意义.结论:100％乙醇直接处理方式更适合用于LMD切割样品的防降解预处理,可显著减少切割过程中的组织RNA完整度破坏.该步操作将有利于获得符合高通量实验质检标准的芯片实验样本.