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应用DNA工作站进行批量血斑STR分型的研究

     

摘要

目的 建立对大批量血斑样品PCR-STR基因分型检测的自动化新方法.方法 应用自动化DNA工作站改良优化Chelex-100法和DNA IQ磁珠法的实验条件,建立两种批量血斑的自动化DNA提取方法;筛选确定PCR-STR反应体系的构建和PCR-STR产物测序电泳分析前处理程序.结果 1104份血斑样品经Chelex-100法批量提取、Profiler Plus试剂盒扩增均一次检出9个STR基因座,定量PCR测定模板浓度均值为0.43ng/ml,荧光检测信号在200~800RFU之间;对其中114份血斑样品用DNA IQ磁珠法批量提取、同试剂盒扩增均一次检出9个STR基因座,定量PCR测定模板浓度均值为0.7ng/ml,荧光检测信号在1000~2000 RFU之间;对其中50份血斑进行自动和手动Chelex-100检验法比较,成功率分别为100%和98%,且前者等位基因峰高信号更均衡.结论 本文建立的自动化DNA工作站批量检测方法,在成功率、稳定性、均一性等方面具有优势.

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