一个Ⅱ型糖尿病合并恶性肿瘤发生家系的基因变异分析

摘要

目的对一个Ⅱ型糖尿病（T2DM）合并恶性肿瘤复杂家系进行基因变异分析,筛选其候选致病/易感基因。方法用全外显子组测序（WES）技术对T2DM合并恶性肿瘤复杂家系的11名成员进行DNA测序,用生物信息学方法筛选候选致病/易感突变,并用Sanger测序对候选突变进行验证。结果该家系共21人,其中11人诊断为T2DM,7人诊断为乳腺癌、胃癌、胰腺癌或脑瘤。对11名家系成员（7人诊断为T2DM,两人诊断为乳腺癌）进行了WES测序分析,筛选出6个候选糖尿病相关突变,其中功能丢失型（TOF）突变1个为瞬时受体电位阳离子M亚家族成员1（TRPM1） c.G4240T p.E1414X;非LOF突变5个,涉及腺苷酸激酶7（AK7）、CROCC、溶质载体家族15成员1（SLC15A1）、丝氨酸羟甲基转移酶2（SHMT2）、Teashirt锌指同源异型盒2（TSHZ2）基因。同时还筛选得到4个肿瘤相关遗传位点（rs3184504、rs1053338、rs11894115和rs11552449）。结论 TRPM1 c.G4240T变异可能是导致该家系糖尿病合并肿瘤发生的关键候选变异;而rs3184504、rs1053338、rs11894115和rs11552449遗传位点可能为该家系乳腺癌易感性位点。