具有胃癌遗传风险的关键长链非编码RNA筛选及验证

摘要

目的筛选胃癌遗传风险关键长链非编码RNA（lncRNA）进行筛选和验证。方法选择直系3代亲属患有胃癌的5对胃癌组及其配对正常组织,采用Agilent Array平台行lncRNA芯片检测lncRNA表达水平,筛选具有胃癌遗传风险的异常表达的lncRNA。为了验证芯片可靠性,随机选取4个异常表达的lncRNAs,对72对胃癌及其配对正常组织采用反转录-聚合酶链反应（RT-PCR）检测。结果与正常组织比较,将胃癌组织中表达变化2倍以上者确定为差异表达者,其中1 300个lncRNAs表达上调和1 807个lncRNAs表达下调。将胃癌组织中表达变化10倍以上者确定为差异表达者,其中55个lncRNAs表达上调和372个lncRNAs下调。随机选择3个上调的lncRNA（H19、HOTAIRM1和HCG18）和1个下调lncRNA（LNC00261）,采用RT-PCR检测72对胃癌及其配对正常组织。RT-PCR检测与芯片检测结果差异无统计学意义（H19:t=1.332,P=0.314;HOTAIRM1:t=0.913,P=0.458;HCG18:t=1.517,P=0.269;LINC00261:t=0.176,P=0.876）。结论lncRNAs在具有胃癌遗传风险的组织中存在异常表达,。