2018-2019年辽宁省甲型流感病毒流行株HA基因进化与疫苗株匹配度分析

摘要

目的 分析辽宁省2018-2019年甲型流感毒血凝素(hemagglutinin,HA)基因,计算并评估流行株与疫苗株的匹配度.方法 选取2018-2019年49株甲型流感毒株进行测序,对HA基因进行进化分析;研究抗原表位、糖基化位点及受体结合位点变异情况;采用Pepitope模型对流行株与疫苗匹配度进行分析.结果 2018-2019年流感流行季为11月份至次年3月份,主要流行型别为新甲型H1N1亚型.经进化分析,新甲型H1N1流行株属于6B.1分支,与当年疫苗株属于同一分支;季节性H3N2毒株分布在3C.2a分支上,与2018-2019年疫苗株处于同一分支,但2019-2020年疫苗株位于3C.3a分支.部分毒株在抗原表位及受体结合位点上发生了突变.若干毒株与疫苗株相比,糖基化位点发生了增加或缺失,并未出现新的糖基化位点.使用Pepitope模型对疫苗效力从分子水平进行评估,本年度新甲型H1N1流感疫苗效力及2019-2020年疫苗株预测效力均能达到较为理想的效果.但是季节性H3N2疫苗株与本年度流行株匹配度低,计算出的疫苗效力半数以上为负值.2019-2020年H3N2亚型疫苗株效力有待进一步观察.结论 2018-2019年辽宁省甲型H1N1流行株发生了一定程度的变异,H3N2亚型流行株与2018-2019年疫苗株匹配度低.应密切关注流行株的基因变异情况并及时更新疫苗株.