中国分离乙脑病毒与灭活疫苗株（P3株）E基因差异分析

摘要

目的分析我国近年来从蚊虫及患者标本中分离的乙脑病毒与灭活疫苗株（P3株）之间在E基因区段核苷酸及氨基酸差异。方法从GenBank中获取相应乙脑病毒株E基因区段核苷酸序列,通过Clustal X（1·8）、DNASTAR、GENEDOC（3·2）等生物学软件进行分析。结果P3株与福建分离株之间核苷酸同源性在98·3%~98·5%之间、氨基酸同源性在98·2%~98·6%之间;P3株与上海分离株之间核苷酸同源性在88·0%~88·5%之间、氨基酸同源性在98·0%~98·4%之间。E基因区段500个氨基酸中P3株与所有新分离乙脑病毒株之间共存在19个位点的差异,其中在E-76、E-306、E-408处所有新分离毒株与P3株存在共同的差异;在E-160、E-487处福建分离株与P3株存在共同差异;上海分离株与P3株在E-129、E-222、E-227、E-366存在共同差异。结论上海蚊虫中分离的Ⅰ型乙脑病毒和福建省脑炎患者中分离的Ⅲ型乙脑病毒与P3株在E基因的部分氨基酸位点存在差异,但均不处在影响病毒生物学特性的关键位点。