基因芯片表达谱筛选Kaposi肉瘤相关基因

摘要

目的筛选Kaposi肉瘤相关基因。方法新疆本地1例经典型Kaposi肉瘤患者,提取病灶组织及正常皮肤组织的总RNA,逆转录成cDNA,采用实时荧光定量PCR（RT-qPCR）的方法检测Kaposi肉瘤相关疱疹病毒（Kaposi sarcoma-associated herpersivirus,KSHV）基因K8.1、K2、ORF50在组织中的表达来确定所取标本有无交叉污染。随后进行荧光标记制备探针,与含有25100条人类基因的35KcDNA基因表达谱芯片进行杂交,用扫描仪扫描芯片荧光信号图像,并用软件对扫描图像进行数字化处理和分析。结果 RT-qPCR检测到KSHV基因在Kaposi肉瘤病灶组织中的存在,而正常皮肤组织中未检测到,说明样本取材无交叉污染。在25 100个基因中,共有1313条差异基因,其中756条基因表达上调,557条基因表达下调。差异表达显著的基因涉及细胞凋亡、血管发生、细胞信号传导、蛋白加工和细胞周期调节等,如髓样细胞白血病-1基因（MCI-1）、膜联蛋白基因、丝氨酸蛋白酶抑制剂（SPINK5）基因等。结论 MCI-1、SPINK5等基因可能与Kaposi肉瘤的发病有关联。