高分辨率熔解技术检测冠心病关联基因标签单核苷酸多态性

摘要

目的 建立高分辨率熔解(HRM)技术检测冠心病关联基因的标签单核苷酸多态性(SNPs)的方法;并探讨其与兰州地区汉族人群冠心病(CHD)易感性及血脂指标的相关性.方法 建立CHD5个关联基因CRP、ACE、NOS3、ENPP1、IQSEC1的7个SNPs住点(rs1205C ＞T、rs4305A＞G、rs4353 G＞A、rs7830 C＞A、rs12528076C＞T、rs939899G＞A、rs1108640G＞ C)的PCR-HRM检测方法,并用260例CHD患者和238例体检健康者进行验证.结果 标本经PCR扩增后均能进行基因分型,经直接测序验证,其分型正确率达100％.病例-对照分析显示rs4353 G＞A和rs12528076 C＞T等位基因频率在CHD组和对照组间差异有统计学意义(x2=3.998,P=0.045;x2 =3.918,P=0.047),rs7830 C＞A基因型频率在两组间差异亦有统计学意义(x2=6.369,P=0.041).血脂水平分析显示,CHD患者与rs 1205位点高密度脂蛋白胆固醇(HDL-C)水平存在相关性(F=14.067,P=0.001).结论 PCR-HRM检测是一种快速、准确的基因分型方法.ACE、NOS3和ENPP1与兰州地区汉族人群CHD易感性相关,其中rs1205 C＞T联合HDL-C血清水平检测可预警CHD发生.