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大肠埃希菌和志贺菌mazEF基因搜索及蛋白分子进化分析

         

摘要

目的对已完成基因组测序的10株大肠埃希菌、6株志贺氏菌和1株未定名肠杆菌进行MazE和MazF蛋白的分子进化分析。方法用BioCyc提供的Pathway Tools(13.5版)搜索已完成基因组测序的10株大肠埃希菌、6株志贺菌和1株未定名肠杆菌毒素MazF编码基因muzF(别名chpA)和抗毒素MazE编码基因mazE(别名chpR),再用MECA4.1软件中的Minimum Evolution法对MazE和MazF蛋白做分子进化分析。结果共有12株搜索到毒素MazE(编码基因为,mazF),11株搜索到抗毒素MazE(编码基因为mazE),另有5株没有搜索到MazEF编码基因。分子进化分析提示大肠埃希菌和志贺菌的mazE和mazF的保守性较好。结论 MazEF是在原核染色体发脱的第一个毒素-抗毒素(TA)系统,但不是每株大肠埃希菌和志贺菌均存在这个系统,有可能存在其他TA系统。MazEF缺失株表现为对抗菌药物抵抗,又因MazEF介导细菌的细胞程序性死亡,mazEF有可能成为抗菌药物的新靶位。

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