高通量测序方法分析两种草食性淡水螺肠道菌群多样性

摘要

淡水螺是水生态系统中重要的生物类群,也是多种寄生虫的中间宿主.肠道菌群在动物能量代谢和抵抗病原体方面起着重要作用.本文分析了耳萝卜螺Radix auricularia和三旋卷丽螺Planorbella trivolvis肠道菌群的多样性.结果表明:在门水平上,耳萝卜螺有23个菌门,以变形菌门(Proteobacteria,33.63％)、蓝细菌门(Cyanobateria,15.33％)、绿弯菌门(Chloroflexi,13.95％)和放线菌门(Actinobacteria,1299％)为主;三旋卷丽螺有13个菌门,以变形菌门(54.88％)、拟杆菌门(Bacteroidetes,28.49％)和放线菌门(7.65％)为主.属水平上,耳萝卜螺有厚皮藻属Pleurocapsa、硫网菌属Thiodictyon、纤毛菌属Leptotrichia及类诺卡氏菌属Nocardioides等445个属;三旋卷丽螺有Cloacibacterium、OM60NOR5_clade、假单胞菌属Pseudomonas及红杆菌属Rhodobacter等238个属.有93个菌属为两种螺的共有核心菌群(所有样本中都存在),其中27个菌属丰度大于0.5％.两种螺肠道菌群结构差异显著(P=0.027).PICRUSt功能预测分析表明,两种螺肠道菌群KEGG功能组成相似,氨基酸代谢、碳水化合物代谢及膜转运丰度较大.综上,两种草食性淡水螺肠道菌群多样性较高且差异显著,但有数量较多的共有核心菌群.